POSSUM 网站一共给出了21种PSSM的”变形“，这21种”变形“出自13篇不同的论文，我简单阅读这13篇论文，对各个PSSM做了一个简单的归纳，为了与原始论文中的描述一致，下面描述中采用的PSSM的维数为（蛋白质长度，20），与维基百科正好相反。 一、21种”变形“PSSM POSSUM的原论文： Wang J, Yang B et al. …

[mathjax] ​ 最近应导师要求，需要在POSSUM网站上生成氨基酸序列对应的21种以PSSM为基础的特征，博主本身从未接触过PSSM，因此想记录一下整个学习过程。 一、什么是PSSM ​ PSSM全称是“position-specific scoring matrix”，翻译成中文为“位置特异性打分矩阵”，也称为“位置比重矩阵”。对于氨基酸…